La Secretaría de Medio Ambiente y Desarrollo Sustentable es la entidad encargada de aplicar las disposiciones de la Constitución Política del Estado Libre y Soberano de Baja California, en materia de desarrollo sustentable, prevención, preservación y restauración del equilibrio ecológico, así como la protección al ambiente del territorio del Estado de Baja California.

Impulsar el desarrollo económico del Estado bajo la visión de un desarrollo sustentable, donde los desarrolladores y ciudadanos en general, se responsabilicen por la protección del medio ambiente y la conservación de la biodiversidad, y entiendan la relevancia de promover el aprovechamiento de los recursos naturales de una manera sostenible, para que el desarrollo económico y social de nuestra comunidad sea congruente con la normatividad ambiental y respetuoso de la naturaleza, y exista compromiso para minimizar los efectos adversos del cambio climático.

Ser una institución líder comprometida con la protección y conservación del medio ambiente que asegure la sustentabilidad regional en armonía con el desarrollo económico planificado, con facultad para conducir la política ambiental, orientar la gestión, realizar acciones en alianza con los sectores productivos, académicos, sociales y organismos internacionales, responsable en el aprovechamiento y protección a la diversidad biológica y los ecosistemas, dotando a la población de una cultura ambiental, impulsora de la investigación científica y la innovación tecnológica, así como promotora de las buenas prácticas en procesos productivos y tecnologías limpias en el Estado de Baja California para lograr la calidad de vida que se merecen los habitantes de la región, que incluye la integridad ambiental de la región.