La Secretaría de Medio Ambiente y Desarrollo Sustentable, tiene como principales atribuciones está el atender y dar seguimiento a los asuntos ambientales en la entidad (Reglamento Interno de la Secretaría de Medio Ambiente y Desarrollo Sustentable , publicado en el Periódico Oficial de B.C. el 31 de diciembre del 2021); en concordancia con las atribuciones conferidas en el artículo 8 de la Ley de Protección al Ambiente para el Estado de Baja California, y demás aplicables en la materia.
Oficina del Titular (06-112)
Subsecretaría de Protección al Medio Ambiente (59-112)
Órgano Interno de Control (06-152)
Dirección de Administración (06-131)
Coordinación de Legalidad Ambiental (06-142)
Dirección de Auditoria, Inspección y Vigilancia (59-612)
Departamento de Auditoria (59-622)
Dirección de Impacto Ambiental (61-212)
Departamento de Impacto Ambiental Mexicali (61-221)
Departamento de Impacto Ambiental Tijuana (61-232)
Departamento de Impacto Ambiental Ensenada (61-243)
Dirección de Recursos Naturales (60-511)
Departamento de Vida Silvestre (60-523)
Departamento de Áreas Naturales Protegidas (60-533)
Dirección de Gestión Ambiental (61-312)
Departamento de Prevención de la Contaminación (61-322)
Departamento de Monitoreo de Contaminación Vehicular (61-332)
Departamento de Calidad del Aire (61-342)
Dirección de Política Ambiental y Cambio Climático (61-412)
Departamento de Política Ambiental (61-422)
Departamento de Cambio Climático (61-432)
Departamento de Planeación y Estadística (61-422)